Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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FOXE3Q13461 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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FOXE3Q13461 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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FOXE3Q13461 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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FOXE3Q13461 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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FOXE3Q13461 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXE3Q13461 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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