Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
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