Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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GPS1Q13098 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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GPS1Q13098 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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GPS1Q13098 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPS1Q13098 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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