Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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FOXD4Q12950 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FOXD4Q12950 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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