Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TROQ12816 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TROQ12816 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TROQ12816 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TROQ12816 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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