Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDE4BQ07343 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDE4BQ07343 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms