Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms