Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms