Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFITM3Q01628 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms