Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms