Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMF1P82094 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMF1P82094 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMF1P82094 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMF1P82094 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMF1P82094 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms