Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HERVK_113P61574 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms