Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms