Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms