Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PGGT1BP53609 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGGT1BP53609 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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