Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms