Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRT6CP48668 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms