Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ECI1P42126 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ECI1P42126 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ECI1P42126 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ECI1P42126 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ECI1P42126 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ECI1P42126 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ECI1P42126 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ECI1P42126 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ECI1P42126 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ECI1P42126 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ECI1P42126 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ECI1P42126 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ECI1P42126 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms