Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms