Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB2P29033 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms