Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLD1P28340 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLD1P28340 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms