Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP24386 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP24386 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP24386 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP24386 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP24386 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP24386 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP24386 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP24386 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP24386 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP24386 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP24386 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHMP24386 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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