Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
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