Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms