Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms