Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CCL3L1P16619 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCL3L1P16619 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms