Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB1P16220 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB1P16220 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREB1P16220 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREB1P16220 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREB1P16220 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB1P16220 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms