Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms