Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms