Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOP08100 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOP08100 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOP08100 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOP08100 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOP08100 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOP08100 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOP08100 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOP08100 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOP08100 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms