Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APODP05090 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APODP05090 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APODP05090 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APODP05090 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APODP05090 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APODP05090 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APODP05090 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms