Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms