Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TLR5O60602 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLR5O60602 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLR5O60602 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLR5O60602 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLR5O60602 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLR5O60602 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLR5O60602 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLR5O60602 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLR5O60602 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLR5O60602 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms