Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA2O43364 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms