Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRTM2O43300 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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