Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA8A3KMH1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA8A3KMH1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms