Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRBV6-7A0A0A0MS04 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRBV6-7A0A0A0MS04 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRBV6-7A0A0A0MS04 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRBV6-7A0A0A0MS04 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRBV6-7A0A0A0MS04 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRBV6-7A0A0A0MS04 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRBV6-7A0A0A0MS04 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRBV6-7A0A0A0MS04 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV6-7A0A0A0MS04 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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