Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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IFT52Q9Y366 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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IFT52Q9Y366 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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IFT52Q9Y366 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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