Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms