Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIMKLBQ9ULI2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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