Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms