Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms