Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms