Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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