Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms