Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSPNQ9HAW4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms