Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BHLHE41Q9C0J9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms