Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms