Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCP2Q9BX26 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms