Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBF4Q9BQW3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms